Библиотеката Клементинум, прекрасен дело на барокната архитектура, за првпат била отворена во 1722 година како дел од Језуитскиот универзитет, и во неа се сместени преку 20.000 книги.
Таванските фрески биле насликани од Јан Хиебл. Во 1871 година, директрот Карел Рафаел Унгар ја основал Националната Библиотека, збирка од литература на чешки јазик. Некои од ретките книги со историско значење од оваа библиотека биле пратени на Гугл за скенирање и ќе станат достапни на Google Books.
Покрај тоа што библиотеката е ретко и малку познато богатство, таа е поврзана и со некои малку познати, но интересни факти: Клементинум бил третиот по големина језуитски универзитет во свето; бележењето на локалното време започнало таму во 1775 година и се практикува сѐ до денес; спомнат е во роман од славниот шпански писател Хорхе Луис Борхес.